Moyashimon

Tadayasu Sawaki n'est pas vraiment un élève normal... Il peut voir les microbes et les bactéries, et même communiquer avec eux. Ces organismes sont plus grands à ses yeux, et totalement different de ce que l'on peut voir au microscope.

C'est avec son ami, Kei Yūki, qu'il entrera à l'Université de l'Argiculture, à Tokyo, où le professeur Keizō Itsuki semble déjà connaître le don de Sawaki. L'élève / assistante du professeur Itsuki, Haruka Hasegawa, qui ne crois pas en ce don, lui fera passer de nombreux tests avant de pouvoir croire en lui, tandis que d'autres personnes essayeront d'utiliser ce pouvoir à des fins personnels...